Dali Domain Dictionary - это структурная классификация белковых доменов. Домены определяются автоматически (программой Dali) путем оптимизации топологических повторений в больших и компактных субъединицах известных белковых структур. Программа классифицирует все известные трехмерные структуры в PDB-EBI, последнее обновление датировано сентябрем 1998 года.
Dietmann S., Park J., Notredame C., Heger A., Lappe M., Holm L. (2001) Nucl. Acids Res., 29, 55-57.
L. Holm, C. Sander (1999) Nucl. Acids Res., 27, 244-247.
Holm L., Sander C. (1998) Nucl. Acids Res., 26, 316-319.
Holm L., Sander C. (1998) Proteins 33, 88-96,
Holm L., Sander C. (1997) Nucl. Acids Res., 25, 231-234.
Holm L., Sander C. (1996) Nucl. Acids Res., 24, 206-209.
Адрес: http://www.embl-ebi.ac.uk/dali/domain/3.1beta/
См. также:
COMPEL - a database on COMPosite ELements
CSD - the Cambridge Structural Database
CUTG - Codon usage tabulated from GenBank
CyanoBase - the genome dataBase for Cyanobacteria
CyanoMutants
DBCat - a catalog of biological DataBases
DBSNP (dbSNP) - the NCBI database of genetic variation
DBSTS [dbSTS] - DataBase of Sequence-Tagged Sites
DDBJ - DNA Data Bank of Japan
DHMHD - the Dysmorphic Human-Mouse Homology Database
...
Обсудить на форуме
