CSD - Кэмбриджская база данных структур хранит информацию и кристаллических структурах органических и металл-органических соединений. Все эти структуры подвергнуты рентгеноструктурному анализу или исследованию методами рассеяния нейтронов. Для каждого объекта база содержит различную информацию, которую можно подразделить на три типа по "размерности": Одномерные данные.
Эти поля документа базы содержат весь библиографический материал о кристаллической структуре и данные о размерах кристаллической решетки и пространственных группах. Сведения о полиморфичности, биологической активности и др. тоже присутствуют, где это возможно.
Двумерная информация.
В этой части документа приводится условная химическая диаграмма молекулы. Она представлена в виде таблицы химических связей, содержащей атомы и свойства связей.
Трехмерная информация.
В этой части документа базы содержится трехмерное представление молекулы. Поля соответствующих данных содержат координаты атомов, симметрию пространственных групп, ковалентные радиусы и др данные.
Адрес: http://www.ccdc.cam.ac.uk/prods/csd/csd.html
См. также:
BSD - Biodegradative Strain Database
CE - Databases and Tools for 3-D Protein Structure Comparison and Alignment
CluSTr - a database of clusters of SWISS-PROT+TrEMBL proteins
COG - the database of Clusters of Ortologous Groups of proteins
COMPEL - a database on COMPosite ELements
CUTG - Codon usage tabulated from GenBank
CyanoBase - the genome dataBase for Cyanobacteria
CyanoMutants
DaliDD - Dali Domain Dictionary
DBCat - a catalog of biological DataBases
...
Обсудить на форуме
