ProtRepeatsDB - реляционная база данных, содержащая различные типы аминокислотных повторов в белках, принадлежащих различным организмам. Данные получены различными специализированными программными средствами, созданными авторами. Поисковыми полями в базе являются RefSeq ID, название организма, ключевые слова, Gene Ontology (GO), размер повтора, кратность или образец повторяющейся последовательности. Есть возможность сравнивать повторы в разных организмах. Кроме того, ресурс предоставляет коллекцию программных средств, реализующих различные возможности анализа, включая средства для поиска различных типов повторов и поиска заданных последовательностей в базе данных ProtRepeatsDB программой BLAST.
M.K. Kalita, G. Ramasamy, S. Duraisamy, V.S. Chauhan, D. Gupta (2006) BMC Bioinformatics, 7:336.
Адрес: http://bioinfo.icgeb.res.in/repeats/
См. также:
Predictome - a database of putative functional links between proteins
PRESAGE - Protein Resource Entailing Structural Annotation of Genomic Entities
PRF - Protein Research Foundation databases
PRINTS - database of protein family fingerPRINTS
ProDom - Protein Domain families database
RDP, RDP-II - Ribosomal Database Project
Rebase - Restriction Enzyme dataBASE
RefSeq (LocusLink) - Reference Sequence standards database
RGD - Rat Genome Database
RHDB [RHdb] - Radiation Hybrid DataBase
...
Обсудить на форуме
