База данных кластеров ортологичных групп генов. Кластеры содержат последовательности из полностью просеквенированных геномов, которые принадлежат основным филогенетическим группам. Каждый кластер содержит отдельные белки или группы паралогов из не менее 3 филогенетических групп и соответствует таким образом одному древнему консервативному району. Все известные белки различных эукариотических геномов распределены по кластерам.
R.L.Tatusov, N.D.Fedorova, J.D.Jackson, A.R.Jacobs, B.Kiryutin, E.V.Koonin, D.M.Krylov, R.Mazumder, S.L.Mekhedov, A.N.Nikolskaya, B.S.Rao, S.Smirnov, A.V.Sverdlov, S.Vasudevan, Y.I. Wolf, J.J. Yin, D.A.Natale (2003)BMC Bioinformatics, 4, 41
Tatusov R.L., Natale D.A., Garkavtsev I.V., Tatusova T.A., Shankavaram U.T., Rao B.S., Kiryutin B., Galperin M.Y., Fedorova N.D., Koonin E.V. (2001) Nucleic Acids Res., 29(1), 22-28.
Tatusov R.L., Galperin M.Y., Natale D.A., Koonin E.V. (2000) Nucl. Acids. Res., 28, 33-36.
Tatusov R.L., Koonin E.V., Lipman D.J. (1997) Science, 278, 631-637.
Адрес: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/
См. также:
BioMagResBank [BMRB] - repository for data from NMR on proteins, peptides, and nucleic acids
Blocks - most highly conserved regions of proteins
BSD - Biodegradative Strain Database
CE - Databases and Tools for 3-D Protein Structure Comparison and Alignment
CluSTr - a database of clusters of SWISS-PROT+TrEMBL proteins
COMPEL - a database on COMPosite ELements
CSD - the Cambridge Structural Database
CUTG - Codon usage tabulated from GenBank
CyanoBase - the genome dataBase for Cyanobacteria
CyanoMutants
...
Обсудить на форуме
