Относительно новая база данных (создана в 1993 году) содержит двумерные электрофоретические картинки полиакриламидных гелей для белков. Идентификация белков по 2-D PAGE осуществляется различными методиками: сравнением гелей, микросеквенированием, иммуноблотингом, анализом аминокислотного состава и др. Основу базы составляют описания белков, включающие процедуры картирования, физиологическую и патологическцую информацию, экспериментальные данные (изоэлектрическую точку, молекулярный вес, аминокислотный состав, массу белка), библиограяические данные и двумерную картинку геля. Текущая версия содержит данные по 23 2-D PAGE-картам из человека (Liver, Plasma, HepG2, Red blood cells, Lymphoma, HepG2 Secreted Proteins, Cerebrospinal Fluid, Macrophage Like Cell Line, Erythroleukemia Cell, Platelet, Kidney, Promyelocytic Leukemia Cells, Colorectal epithelia cells, Colorectal adenocarcinoma cells), из мыши (Liver, Gastrocnemius muscle, Pancreatic islet cells, Epididymal fat pad), дрожжей, кишечной палочки и Dictyostellium discoideum. Всего 592 единицы хранения (на 15 октября 1999).
Hoogland C., Sanchez J.-C., Tonella L., Binz P.-A., Bairoch A., Hochstrasser D.F., Appel R.D. (2000) Nucleic Acids Res., 28, 286-288.
Hoogland C., Sanchez J.-C., Tonella L., Bairoch A., Hochstrasser D.F., Appel R.D. (1999) Nucleic Acids Res., 27, 289-291.
Адрес: http://www.expasy.ch/ch2d/
См. также:
SeqAnalRef - Sequence Analysis bibliographic Reference database
SGD - Saccharomyces Genome Database
Биологические базы данных, snoRNA - a database for small nucleolar RNAs from Saccharomyces cerevisiae
SRPDB - the Signal Recognition Particle DataBase
SSU rRNA - Small SubUnit rRNA database
SWISS-PROT - the protein sequence data bank
TDB - TIGR DataBases
The gRNA database - the guide RNA database
The Homeodomain Resource
The Molecule Pages database
...
Обсудить на форуме