MEROPS - это каталог и структурная классификация пептидаз (т.е. всех протеолитических ферментов). Эта группа белков (около 2 % всех продуктов генов) имеет большое значение в медицине и биотехнологии. База организована следующим образом: список пептидаз по именам или синонимам дает доступ в отдельные файлы, каждый из которых содержит информацию об одной пептидазе (данные по классификации, номенклатуре, гипертекстовые ссылки на соответствующие базы данных). Другой список организмов дает доступ ко всем известным пептидазам из этого организма. Пептидазы объединены в семейства по статистически значимому сходству белковых последовательностей, но не по всей длине, а в конкретном месте последовательности, называемом пептидазным элементом. Семейства, которые имеют общее эволюционное происхождение и имеют схожие третичные структуры объединяются в кланы пептидаз. Издание 3.03 базы содержит 758 пептидаз, 153 семейства, 22 клана.
Rawlings N.D., Barrett A.J. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 325-331
Адрес: http://www.merops.co.uk/
См. также:
LGIC - Ligand Gated Ion Channel subunit database
LSU rRNA - Large SubUnit rRNA database
MATDB - MIPS Arabidopsis Thaliana DataBase
MBDC - Molecular Biology Database Collection
MedLine - [Medline]
MetaFam - a comprehensive protein family resource
MGI - Mouse Genome Informatics
MIDB - an eukaryotic Mismatched Intron DataBase
MitBASE - integrated Mitochondrial DNA dataBASE
MitBASE Pilot - a database on nuclear genes involved in mitochondrial biogenesis and its regulation in Saccharomyces cerevisiae
...
Обсудить на форуме
