Коллекция последовательностей транспортных РНК и генов тРНК. Состоит из трех частей: - коллекция генов тРНК, она содержит 3279 последовательностей и после 1998 года не пополняется.
- коллекция последовательностей тРНК (включает в себя последовательности, модификации оснований, литературные ссылки). Эта подбаза датирована январем 2002 года.
- коллекция геномных тРНК. Это последовательности генов цитоплазматических тРНК, скомпилированные из полных геномов, полмещенных в нуклеотидные базы данных. Эта подбаза содержит около 3700 генов тРНК из 63 организмов (архей, бактерий, высших и низших эукариот).
Поддерживается совместно Laboratorium fur Biochemie Bayreuth (Germany) и Институтом белка РАН (г.Пущино).
Sprinzl M., Horn C., Brown M., Ioudovitch A., Steinberg S. (1998) Nucl. Acids Res., 26, 148-153.
Steinberg S., Misch A., Sprinzl M. (1993) Nucl. Acids Res., 21, 3011-3015
Адрес: http://library.med.utah.edu/RNAmods/trnabase/
См. также:
Биологические базы данных, tmRDB - tmRNA DataBase
Биологические базы данных, tmRNA - The tmRNA website
TransTerm - Translational Termination signal database
TRDB - Tandem Repeats DataBase
Биологические базы данных, trEMBL - EMBL protein-coding DNA sequence features translated into peptide sequences
TTD - Therapeutic Target Database
UDB - the Unified DataBase for Human Genome Mapping
UniGene
UniProt - the Universal Protein knowledgebase
Vertebrate MitBASE - a dataBASE on Vertebrate Mitochondrial DNA sequences
...
Обсудить на форуме
