База данных последовательностей межгенных спейсеров, расположенных между генами 16S-23S-рибосомальных РНК прокариот. Известно, что рибосомальные спейсеры используются для определения степени родства прокариот в филогенении, популяционной генетике потому что они сильно вариабельны по размерам и по самой последовательности, значительно сильнее, чем фланкирующие районы генов 16S- и 23S-рРНК. Именно эти гены традиционно использовались для определения таксономических взаимосвязей между видами, родами, семействами и т.д. Между тем их внутренние транскрибируемые спейсеры (internal transcribed spacers - ITS) гораздо полезнее для различения на уровне видов и даже штаммов организмов. Это новая база данных, создана она в 2001 году.
Garcia-Martinez J., Bescos I., Rodriguez-Sala J.J., Rodriguez-Valera F. (2001) Nucl. Acids Res., 29, 178-180.
Адрес: http://ulises.umh.es/RISSC/
См. также:
RDP, RDP-II - Ribosomal Database Project
Rebase - Restriction Enzyme dataBASE
RefSeq (LocusLink) - Reference Sequence standards database
RGD - Rat Genome Database
RHDB [RHdb] - Radiation Hybrid DataBase
RNase P Database - the RiboNuclease P Database
RsGDB - Rhodobacter sphaeroides Genome DataBase
SBASE - protein domain library
SCOP - Structural Classification Of Proteins
SELEX_DB - a database on in vitro selected oligomers adapted for recognizing natural sites and for analyzing both SNPs and site-directed mutagenesis data
...
Обсудить на форуме
