Малые ядрышковые РНК участвуют в разрезании рРНК, в модификации нуклеотидов рРНК и, возможно, других аспектах генезиса рибосом в эукариотических клетках. В последние годы открыто множество видов малых ядрышковых РНК из различных эукариот. Предполагается, что индивидуальный организм млекопитающего должен иметь до 200 различных видов этих последовательностей. У дрожжей описано около 70 малых ядрышковых РНК, база данных содержит информацию об этих объектах (название, размер, семейство, организация генов, последовательности, ссылка на соответствующий документ GenBank, возможные гомологии, функциональные особенности и др.). Данные организованы в виде таблиц.
В Вашингтонском университете St.Louis есть база данных (Methylation Guide snoRNA Database), в ней хранится информация по малым ядрышковым РНК из ряда организмов.
Samarsky D.A., Fournier M.J. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 161-164.
Адрес: http://www.bio.umass.edu/biochem/rna-sequence/Yeast_snoRNA_Database/snoRNA_DataBase.html
См. также:
SBASE - protein domain library
SCOP - Structural Classification Of Proteins
SELEX_DB - a database on in vitro selected oligomers adapted for recognizing natural sites and for analyzing both SNPs and site-directed mutagenesis data
SeqAnalRef - Sequence Analysis bibliographic Reference database
SGD - Saccharomyces Genome Database
SRPDB - the Signal Recognition Particle DataBase
SSU rRNA - Small SubUnit rRNA database
Swiss-2dpage
SWISS-PROT - the protein sequence data bank
TDB - TIGR DataBases
...
Обсудить на форуме
