Со времени появления полного генома Haemophilus influenzae Rd в 1995 году началась новая эра в молекулярной биологии. Появилась задача исследования полных геномов вместо фрагментов геномов. Большинство баз данных, созданных еще в 80-е годы, не имеют возможности хранения и обработки полных протяженных геномов, поэтому дробят их на куски порядка по 100 тыс. нуклеотидов. Библиотека микробных геномов (EMGLib) в первом своем выпуске в октябре 1998 года хранила 31 документ, среди которых были законченные геномы бактерий и такие геномы, как например, геном дрожжей, значительная часть которого уже расшифрована. Эти 31 документ хранят в себе геномы целиком, это составляет в сумме 44040174 нуклеотидных пары, содержат ссылки на 36225 кодирующих рамки, гены 943 тРНК, 132 рРНК и др. РНК.
Perriere G., Bessieres P., Labedan B. (2000), Nucl. Acids Res., 28, 68-71.
Perriere G., Bessieres P., Labedan B. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 63-65.
Адрес: http://pbil.univ-lyon1.fr/emglib/emglib.html
См. также:
DrugBank
DSSP - Dictionary of Secondary Structure of Proteins
EID - the Exon-Intron Database
EMBL - the EMBL Nucleotide Sequence Database
EMEST
Ensemble - The Ensembl Genome Browser and Annotation System
ENTREZ - Molecular Biology DataBase and Retrieval System
EPD - Eukaryotic Promoter Database
ExInt - Exon Intron Database
ExpressDB (EXD)
...
Обсудить на форуме
