База данных групп структурно родственных белков, группы определяются с помощью нового алгоритма (Combinatorial Extension (CE) algorithm). База снабжена программными средствами для анализа на принадлежность какой-либо группе заданного пользователем белка, этот белок может быть из базы данных PDB или нет, сравниваться он может как со всей базой PDB, так и с заданным ее подмножеством.

Shindyalov I.N., Bourne P.E. (2001) Nucl. Acids Res., 29, 228-229.

Shindyalov I.N., Bourne P.E. (1998) Protein Engineering, 11(9), 739-747.

Адрес: http://cl.sdsc.edu/ce.html

Источник...

Источник:

Сайт: Молекулярная биология. Статья: Молекулярно-биологические базы данных. Статья: CE - Databases and Tools for 3-D Protein Structure Comparison and Alignment.

См. также:

    BioImage - Biological Images for scientific research

    BioKnowledge Library

    BioMagResBank [BMRB] - repository for data from NMR on proteins, peptides, and nucleic acids

    Blocks - most highly conserved regions of proteins

    BSD - Biodegradative Strain Database

    CluSTr - a database of clusters of SWISS-PROT+TrEMBL proteins

    COG - the database of Clusters of Ortologous Groups of proteins

    COMPEL - a database on COMPosite ELements

    CSD - the Cambridge Structural Database

    CUTG - Codon usage tabulated from GenBank

     ...

 Обсудить на форуме