База данных по составным регуляторным элементам (composite elements). Составной регуляторный элемент содержит два близко расположенных сайта связывания для различных транскрипционных факторов и является минимальной функциональной единицей, которая обеспечивает комбинационную регуляцию транскрипции. Эти составные регуляторные элементы геномов, взаимодействуют с двумя и более факторами транскрипции, интегрируя таким образом ответ на некоторые сигнальные пути друг с другом или с механизмами тканевой специфичности или специфичности, связанной с определенной стадией развития организма. Различают два типа составных регуляторных элементов - синергичные и антагонистичные Все элементы этой коллекции получили экспериментальное подтверждение, поэтому все документы базы содержат информацию о соответствующем типе эксперимента и о специфических взаимодействиях. Все документы базы содержат отсылки на соответствующие документы базы данных TRANSFAC.
Kel-Margoulis O., Kel A. E., Reuter I., Deineko I. V., Wingender E. (2002) Nucl. Acids Res., 30, 332-334
Kel-Margoulis O.V., Romaschenko A.G., Kolchanov N.A., Wingender E., Kel A.E. (2000) Nucl. Acids Res., 28, 311-315.
Heinemeyer T., Chen X., Karas H., Kel A.E., Kel O.V. et al. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 318-322.
Heinemeyer T., Wingender E., Reuter I., Hermjakob H., Kel A.E., Kel O.V. et al. (1998) Nucl. Acids Res., 26, 362-367.
Kel O.V., Kel A.E., Romaschenko A.G., Wingender E., Kolchanov N.A. (1997) Mol. Biol. (Mosk)., 31, 498-512.
Wingender E., Kel A.E., Kel O.V., Karas H., Heinemeyer T., Dietze P., Knuppel R., Romaschenko A.G., Kolchanov N.A. (1997) Nucl. Acids Res. 25, 265-268.
Kel O.V., Romachenko A.G., Kel A.E., Wingender E., Kolchanov N.A. (1995) Nucl. Acids Res., 23, 4097-4103.
Адрес: http://compel.bionet.nsc.ru/new/compel/compel.html
См. также:
Blocks - most highly conserved regions of proteins
BSD - Biodegradative Strain Database
CE - Databases and Tools for 3-D Protein Structure Comparison and Alignment
CluSTr - a database of clusters of SWISS-PROT+TrEMBL proteins
COG - the database of Clusters of Ortologous Groups of proteins
CSD - the Cambridge Structural Database
CUTG - Codon usage tabulated from GenBank
CyanoBase - the genome dataBase for Cyanobacteria
CyanoMutants
DaliDD - Dali Domain Dictionary
...
Обсудить на форуме
