Gerontology Explorer
База знаний по геронтологии
Форум Рейтинг способов продления жизни Новые материалы Email-рассылка: информация о новых материалах на сайте RSS-канал: информация о новых материалах на сайте Поиск Указатель Экспорт, импорт

     
PRESAGE - Protein Resource Entailing Structural Annotation of Genomic Entities

 

Структурная геномика предполагает получение экспериментальной структуры или хорошей теоретической модели для каждого белка во всех секвенированных геномах. Экспериментальный и вычислительный аспекты играют критическую роль в структурной геномике. Эксперименты дают основную информацию об относительно малом количестве отдельных белков. Вычислительный аспект может распространить эти знания и применить к потенциальным семействам родственных белков. На практике сначала применяется вычислительный подход для назначения всем геномным белкам белковых структур. Оставшиеся белки объединяются в семейства и представители этих семейств выбираются для экспериментального изучения. Расшифрованная структура сравнивается с другими белками с известной структурой в классификациях, таких как SCOP, CATH, FSSP, для получения информации об эволюции и функции белков. Каждый документ базы PRESAGE описывает один белок из SWISS-PROT, в нем есть подробная аннотация, включающая информацию от различных исследователей.

 

Brenner S.E., Barken D., Levitt M. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 251-253

 

Адрес: http://presage.berkeley.edu/

 

 

См. также:

    PlantCARE - Plant cis-acting regulatory DNA elements database

    PlasmoDB - an integrative database of the Plasmodium falciparum genome

    PLMItRNA - a database for higher Plant MItochondrial tRNAs and tRNA genes

    PMD - Protein Mutant Database

    Predictome - a database of putative functional links between proteins

    PRF - Protein Research Foundation databases

    PRINTS - database of protein family fingerPRINTS

    ProDom - Protein Domain families database

    ProtRepeatsDB

    RDP, RDP-II - Ribosomal Database Project

     ...

 

 Обсудить на форуме

 

Изменен: 27.12.10

Узлов всего: 3 914. Узлов на вкладке: 502. Узлов в узле: 0. Последнее обновление: 20.01.13 19:01

Gerontology Explorer ©, 2007 - 2013. Все права защищены. Для правообладателей Обратная связь

Хостинг от uCoz