База данных аннотированных эукариотических промоторов РНК-полимеразы II, для которых экспериментально определен сайт старта транскрипции. Информация привязана к промоторной последовательности путем указания номера позиции на последовательности в базе EMBL, они содержат информацию о генетически определенных элементах регуляции транскрипции. EPD ограничивается промоторами, узнаваемыми системами РНК-полимераз II у высших эукариот, исключая грибы, водоросли и простейших.Тем не менее, т.к. промоторы рассматриваются как физиологические элементы, зависящие от правильной интерпретации trans-действующим окружением, в базу включено и классифицировано много вирусных промоторов вместе с промоторами их хозяевами.
Schmid C.D., Perier R., Praz V., Bucher P. (2006) Nucl. Acids Res., 34, D82-D85.
Cavin Perier R., Junier T., Bonnard C., Bucher P. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 307-309
Cavin Perier R., Junier T., Bucher P. (1998) Nucl. Acids Res., 26, 353-357
Bucher P., Trifonov E.N. (1986) Nucl. Acids Res., 14, 10009-10026
Адрес: http://www.epd.isb-sib.ch/
См. также:
EMBL - the EMBL Nucleotide Sequence Database
EMEST
EMGLib - Enhanced Microbial Genomes Library
Ensemble - The Ensembl Genome Browser and Annotation System
ENTREZ - Molecular Biology DataBase and Retrieval System
ExInt - Exon Intron Database
ExpressDB (EXD)
FIMM - a database of functional molecular immunology
FlyBase - A Database of the Drosophila Genome
FlyNets
...
Обсудить на форуме
