AMmtDB - коллекция множественных выравниваний митохондриальных генов, кодирующих белки и тРНК у позвоночных животных, а также множественные выравнивания основного регуляторного района митохондриальной ДНК млекопитающих (т.нзв. D-loop region). Гены, кодирующие белки выравнены с учетом транслирующихся с них аминокислотных последовательностей, для них хранятся как нуклеотидные, так и аминокислотные выравнивания. Для генов тРНК при выравнивании учитывается вторичная структура, поэтому для них в базе хранятся выравнивания основанные на сходстве как первичных, так и вторичных структур. В соответствии с наличием трех основных объектов база подразделяется на 3 раздела - множественные выравнивания белковых генов, генов тРНК, D-loop-районов.
Lanave C., Licciulli F., De Robertis M., Marolla A., Attimonelli M. (2002) Nucl. Acids Res., 30, 174-175.
Lanave C., Liuni S., Licciulli F., Attimonelli M. (2000) Nucl. Acids Res., 28, 153-154.
Lanave C., Attimonelli M., De Robertis M., Licciulli F., Liuni S., Sbisa E., Saccone C. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 134-137
Attimonelli M., Calo D., De Montalvo A., Lanave C., Sasanelli D., Tommaseo Ponzetta M., Saccone C. (1998) Nucl. Acids Res., 26, 120-125.
Адрес:
http://bighost.area.ba.cnr.it/srs6bin/wgetz?-page+LibInfo+-lib+AMMTDB
См. также:
5S rRNA - 5S ribosomal RNAs database
AARSDB - AminoAcyl-tRNASynthetases DataBase
AGRICOLA - AGRICultural On-Line Access
Article@inist - inist
ASDB - database of alternatively spliced genes
ASTRAL - The ASTRAL Compendium for Sequence and Structure Analysis
AtDB(TAIR) - Arabidopsis thaliana DataBase
BIOCAT - Bio-Catalog
Biochemical Pathways
BioImage - Biological Images for scientific research
...
Обсудить на форуме
