Подбор in vitro олигомеров, связываюшихся с заданными белками, интенсивно развивается в последнее десятилетие. Он применяется также для избежания повторных циклов при подборе синтетических олигомеров для полимеразной цепной реакции. SELEX_DB содержит как экспериментальные данные по in vitro определенным ДНК/РНК олигомерам (аптамерам) и апплеты для распознавания таких олигомеров.
Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Frolov A.S., Gelfand M.S., Ponomarenko M.P. (2002) Nucl. Acids Res., 30, 195-199.
Ponomarenko J.V., Orlova G.V., Ponomarenko M.P., Lavryushev S.V., Frolov A.S., Zybova S.V., Kolchanov N.A. (2000) Nucl. Acids Res., 28, 205-208.
Адрес: http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/systems/selex/
См. также:
RISSC - Ribosomal Intergenic Spacer Sequence Collection
RNase P Database - the RiboNuclease P Database
RsGDB - Rhodobacter sphaeroides Genome DataBase
SBASE - protein domain library
SCOP - Structural Classification Of Proteins
SeqAnalRef - Sequence Analysis bibliographic Reference database
SGD - Saccharomyces Genome Database
Биологические базы данных, snoRNA - a database for small nucleolar RNAs from Saccharomyces cerevisiae
SRPDB - the Signal Recognition Particle DataBase
SSU rRNA - Small SubUnit rRNA database
...
Обсудить на форуме