База данных содержит семейства белков, для них построены множественные выравнивания и скрытые марковские модели, что обеспечивает автоматическую функциональную идентификацию белков по сходству последовательностей. Авторами введено понятие "эквивалог" для обозначения членов одного набора гомологичных белков, которые законсервировали свою функцию после отпочкования от последнего общего предка.
Haft D.H., Loftus B.J., Richardson D.L., Yang F., Eisen J.A., Paulsen I.T., White O. (2001) Nucleic Acids Res., 29(1), 41-43.
Адрес: http://www.tigr.org/TIGRFAMs
См. также:
SWISS-PROT - the protein sequence data bank
TDB - TIGR DataBases
The gRNA database - the guide RNA database
The Homeodomain Resource
The Molecule Pages database
Биологические базы данных, tmRDB - tmRNA DataBase
Биологические базы данных, tmRNA - The tmRNA website
TransTerm - Translational Termination signal database
TRDB - Tandem Repeats DataBase
Биологические базы данных, trEMBL - EMBL protein-coding DNA sequence features translated into peptide sequences
...
Обсудить на форуме
