PRINTS - коллекция белковых мотивов (protein fingerprints). Отпечатком называется группа консервативных мотивов, которая служит для характеристики семейства белков. Обычно мотивы не перкрываются, на первичной структуре они разнесены по длине последовательности. Но в третичной структуре они могут быть рядом. Отпечатки (Fingerprints) могут кодировать укладку белка и функциональную нагрузку более сложную, чем просто мотив. Версия 24.0 (октябрь 99) содержит 1210 единиц хранения, описывающих более 6000 отдельных мотивов.
Attwood, T.K., Blythe, M., Flower, D.R., Gaulton, A., Mabey, J.E., Maudling, N., McGregor, L., Mitchell, A., Moulton, G., Paine, K. and Scordis, P. (2002) Nucl. Acids Res., 30(1), 239-241.
Attwood, T.K. (2002) Briefings in Bioinformatics, 3(3), 252-263.
Attwood T.K., Flower D.R., Lewis A.P., Mabey J.E., Morgan S.R., Scordis P., Selley J.N., Wright W. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 220-225
Attwod T.K., Beck M.E., Bleasby A.J., Parry-Smith D.J. (1994) Nucl. Acids Res., 22, 3590-3596.
Адрес: http://bioinf.man.ac.uk/dbbrowser/PRINTS
См. также:
PLMItRNA - a database for higher Plant MItochondrial tRNAs and tRNA genes
PMD - Protein Mutant Database
Predictome - a database of putative functional links between proteins
PRESAGE - Protein Resource Entailing Structural Annotation of Genomic Entities
PRF - Protein Research Foundation databases
ProDom - Protein Domain families database
ProtRepeatsDB
RDP, RDP-II - Ribosomal Database Project
Rebase - Restriction Enzyme dataBASE
RefSeq (LocusLink) - Reference Sequence standards database
...
Обсудить на форуме
