Первая база данных по протеому одного организма, содержит всю известную на данный момент информацию о белках эукариотической клетки дрожжей Saccharomyces cerevisiae, наиболее изученного живого организма, 3000 белков из общего количества 6100 которой уже охарактеризовано биохимически и(или) генетически. Для каждого из 6100 дрожжевых белков есть документированная аннотация. Обновляется еженедельно. Содержит более 50000 строк аннотаций, сконцентрировавших обзоры 8500 научных публикаций. В последнее время обновлена схема классификации белков, учитывающая роль белка в клетке, функцию и пути.
Costanzo M.C., Crawford M.E., Hirschman J.E., Kranz J.E., Olsen P., Robertson L.S., Skrzypek M.S., Braun B.R., Hopkins K.L., Kondu P., Lengieza C., Lew-Smith J.E., Tillberg M., Garrels J.I. (2001) Nucleic Acids Res., 29(1), 75-79.
Costanzo M.C., Hogan J.D., Cusick M.E., Davis B.P., Fancher A.M., Hodges P.E., Kondu P., Lengieza C., Lew-Smith J.E., Lingner C., Roberg-Perez K.J., Tillberg M., Brooks J.E., Garrels J.I. (2000) Nucl. Acids Res., 28, 73-76.
Hodges P.E., McKee A.H.Z., Davis B.P., Payne W.E., Garrels J.I. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 69-73.
Адрес:
http://www.proteome.com/databases/index.html
http://www.proteome.com/
См. также:
TTD - Therapeutic Target Database
UDB - the Unified DataBase for Human Genome Mapping
UniGene
UniProt - the Universal Protein knowledgebase
Vertebrate MitBASE - a dataBASE on Vertebrate Mitochondrial DNA sequences
Virgil - Virgil database for rich links
WANDA - A database of duplicated genes in fish
WormBase
Z Curve Database - Z Curve Database of Genomes
ZFIN - The Zebrafish Information Network
...
Обсудить на форуме
