PDB - коллекция экспериментально определенных 3D-структур биологических макромолекул. Раньше содержала и теоретические модели, но начиная с июля 2002 года в основном депозитарии хранятся только экспериментально определенные структуры (рентгеноструктурным, ядерно-агнитнорезонансным и др. методами). Теоретические структуры выделены в отдельную подбазу, которая доступна для перекачки по FTP. Есть зеркальные сайты в EBI, Австралии и Израиле.
Berman H.M., Westbrook J., Feng Z., Gilliland G., Bhat T.N., Weissig H., Shindyalov I.N., Bourne P.E. (2000) Nucl. Acids Res., 28, 235-242.
Bernstein F.C., Koetzle T.F., Williams G.J.B., Meyer E.F., Brice M.D., Rodgers J.R., Kennard O., Shimanouchi T., Tasumi M. (1977) J.Mol.Biol., 112, 535-542
Адрес: http://www.rcsb.org/pdb/
PDB: Protein Data Bank (http://www.rcsb.org/pdb/)
|
|
|
Сайт: Институт цитологии и генетики.
Статья: "Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития", А.В. Ратушный, В.А. Лихошвай, Е.А. Ананько, Н.В. Владимиров, К.В. Гунбин, С.А. Лашин, Е.А. Недосекина, С.В. Николаев, Л.В. Омельянчук, Ю.Г. Матушкин, Н.А. Колчанов, 2005 г.
Исходный раздел: Базы данных по ферментам, низкомолекулярным веществам и реакциям
|
См. подраздел 
MMDB - Molecular Modelling DataBase.
Обсудить на форуме
