Специализированная база данных, собравшая в себя промоторы генов растений вместе с их регуляторными элементами cis-действия. Данные собраны из литературы, степень их достоверности зависит от того, как они были найдены - экспериментально или в результате поиска гомологий авторами статей. Версия базы, датированная сентябрем 2002 года содержит 435 регуляторных элементов: 149 из однодольных, 281 из двудольных и 5 из других высших растений, которые описывают 159 промоторов из высших растений. Информация организована в виде реляционной базы данных. Родственные базы - TFD и TRANSFAC, которая, видимо, создавалась независимо и одновременно.
Rombauts S., Dehais P., Van Mantagu M., Rouse P. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 295-296
Адрес: http://oberon.fvms.ugent.be:8080/PlantCARE/index.html
См. также:
PALI - a database of Phylogeny and ALIgnment of homologous protein structures
PFAM - Protein families database of alignments and HMMs
PIR - Protein Information Resource
PIR-ALN - database of Protein sequence ALligNments
PLACE - PLAnt Cis-acting regulatory DNA Elements database
PlasmoDB - an integrative database of the Plasmodium falciparum genome
PLMItRNA - a database for higher Plant MItochondrial tRNAs and tRNA genes
PMD - Protein Mutant Database
Predictome - a database of putative functional links between proteins
PRESAGE - Protein Resource Entailing Structural Annotation of Genomic Entities
...
Обсудить на форуме
