В базе данных собраны все первичные структуры белков, для которых известны 3D-структуры, в виде множества выравниваний, которые получены методом динамического программирования (MAXHOM). Каждое семейство 1D-структур основано на общей 3D-структуре. Содержит, кроме семейств выравненных последовательностей, вторичные и третичные структуры для 36% всех последовательностей SWISS-PROT тоже содержит семейства последовательностей, но эти семейства основаны на другом принципе - общности доменов.
Sander C., Schneider R. (1994) Nucl. Acids Res., 22, 3597-3599
Sander C., Schneider R. (1991) Proteins, Structure, Function & Genetics, 9, 56-68.
Holm L., Sander C. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 244-247
Адрес: http://www.sander.ebi.ac.uk/hssp/
См. также:
HGNC - The HUGO Gene Nomenclature Committee Database
HGNDB - Human Gene Nomenclature DataBase
Histones - Histone sequence database
HIV Molecular Immunology Database
HOVERGEN - HOmologous VERtebrate GENs database
HUGE - Human Unidentified Gene-Encoded large protein database
HuGeMap - the Human Genome Maps database
Human MitBASE
HUMBIO - NUMan BIOology database
HvrBase - primates mtDNA control region sequences compilation
...
Обсудить на форуме
