База данных FlyNets содержит информацию по молекулярным взаимодействиям (белок-ДНК, белок-РНК и белок-белок) в плодовой мухе Drosophila melanogaster. База данных разбита на 2 подбазы. В первой из них - FlyNets-base - собрана информация по всем молекулярным взаимодействиям на протяжении развития организма. Каждое сложное взаимодействие, в котором участвуют более 2 партнеров (например, взаимодействие ДНК с несколькими факторами транскрипции или между несколькими белками в многомерном комплексе) раскладывается на несколько попарных взаимодействий. Эта подбаза является преемницей существовавшей ранее базы GIF-DB (Gene Interactions in the Fly Database). Документы этой базы представляют собой гипертекстовые файлы в формате, напоминающем формат GenBank. Версия 2.0 (январь 1999) содержит 80 детально описанных парных взаимодействия.
Вторая подбаза - FlyNets-list - содержит список известных у Drosophila melanogaster взаимодействий без всякой информации, но снабженные гиперссылками на базы Medline.
Sanchez C., Lachaize C., Janody F., Bellon B., Roder L., Euzenat J., Rechenmeann F., Jacq B. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 89-94.
Mohr E., Horn F., Janody F., Sanchez C., Pillet V., Bellon B., Roder L., Jacq B. (1998) Nucl. Acids Res., 26, 89-93.
Адрес: http://gifts.univ-mrs.fr/FlyNets/FlyNets_home_page.html
См. также:
EPD - Eukaryotic Promoter Database
ExInt - Exon Intron Database
ExpressDB (EXD)
FIMM - a database of functional molecular immunology
FlyBase - A Database of the Drosophila Genome
FSSP - Fold classification based on Structure-Structure alignment of Proteins
FULL-Malaria - a database for a full-length enriched cDNA library from human malaria parasite, Plasmodium falciparum
GDB - Genome DataBase
GENATLAS
GenBank
...
Обсудить на форуме
