DrugBank - база данных лекарственных веществ с химической, фармакологической и фармацевтической информацией, созданной при University of Alberta. База данных содержит информацию о 4 800 лекарственных веществ, включая: > 1480 соединений, одобренных FDA
128 биологических препаратов
71 nutraceuticals, and
3200 экспериментальных соединений.
Для 2500 белковых мишеней для лекарственных веществ, добавлены их аминокислотные последовательности.
Каждая запись (DrugCard) содержит более 100 полей, из которых более половины являются химическими и фармакологическими данными, другая половина содержит информацию о мишенях действия лекарств.
Сайт и база данных DrugBank в данный момент поддерживается David Wishart и Craig Knox.
Пользователи могут отправлять запросы в DrugBank несколькими способами:
Простой текст запросы всей текстовой компоненты базы данных поддерживаются. Нажатие на кнопку "Обзор" генерирует табличный обзор содержания DrugBank's. Эта точка зрения позволяет пользователям случайно прокрутки базу данных или повторно рода его содержание.
При нажатии на данную кнопку DrugCard выводит на экран полное содержание данных для соответствующего препарата. Полное описание всех полей DrugCard и источники дана там.
Кнопка PharmaBrowse позволяет пользователям просматривать через наркотики, как сгруппированы по их указания. Это особенно полезно для фармацевтов и врачей, но и для фармацевтических исследователей в поисках потенциальных наркотиков приводит.
Кнопка ChemQuery позволяет пользователям рисовать (с использованием MarvinSketch или ChemSketch апплеты) или написать (в виде строки улыбается) химического соединения и поиска DrugBank для химикатов аналогичные или идентичные запрос соединения.
Кнопка TextQuery поддерживает более сложные поиска текста (частичного совпадения слова, с учетом регистра, опечатки и т.д.) текстовая часть DrugBank.
SeqSearch кнопка позволяет пользователям проводить BLASTP (белка) последовательность поисков 18000 последовательностей, содержащихся в DrugBank. Оба одного или нескольких последовательности (т.е. весь протеома) BLAST запросы поддерживаются.
Кнопка Data Extractor открывает легкий в использовании реляционных запросов поисковый инструмент, который позволяет пользователям выбрать или поиск по различным комбинациям подполей. Data Extractor является самым сложным инструментом поиска для DrugBank.
Пользователи могут скачать выделенный текст компонентов и последовательность данных из DrugBank и следить за новейшими DrugBank статистики, нажав на кнопку "Загрузка".
См. также:
DBSNP (dbSNP) - the NCBI database of genetic variation
DBSTS [dbSTS] - DataBase of Sequence-Tagged Sites
DDBJ - DNA Data Bank of Japan
DHMHD - the Dysmorphic Human-Mouse Homology Database
DOMO - protein domain database
DSSP - Dictionary of Secondary Structure of Proteins
EID - the Exon-Intron Database
EMBL - the EMBL Nucleotide Sequence Database
EMEST
EMGLib - Enhanced Microbial Genomes Library
...
Обсудить на форуме
