Содержит информацию об укладке белков, основанную на выравниваниях белков по пространственной структуре (L. Holm and C. Sander (1996) Mapping the protein universe. Science 273:595-602). Белки берутся из Protein Data Bank (PDB). Классификация и выравнивания осуществляются автоматически и регулярно обновляются с использованием июнь 2002 года содержит 3242 семейства последовательностей, представляющих 30624 структуры белков. Поддерживается EBI.

Holm L., Sander C. (1998) Nucl. Acids Res., 26, 316-319.

Holm L., Sander C. (1997) Nucl. Acids Res., 25, 231-234.

Holm L., Sander C. (1996) Nucl. Acids Res., 24, 206-209.

Holm L., Sander C. (1994) Nucl. Acids Res., 22, 3600-3609.

Holm L., Ouzounis C., Sander C., Tuparev G. and Vriend G. (1992) Prot.Sci., 1, 1691-1698

Адрес: http://www2.ebi.ac.uk/dali/fssp/

Источник...

Источник:

Сайт: Молекулярная биология. Статья: Молекулярно-биологические базы данных. Статья: FSSP - Fold classification based on Structure-Structure alignment of Proteins.

См. также:

    ExInt - Exon Intron Database

    ExpressDB (EXD)

    FIMM - a database of functional molecular immunology

    FlyBase - A Database of the Drosophila Genome

    FlyNets

    FULL-Malaria - a database for a full-length enriched cDNA library from human malaria parasite, Plasmodium falciparum

    GDB - Genome DataBase

    GENATLAS

    GenBank

    GeneCards - encyclopedia for genes, proteins and diseases

     ...

 Обсудить на форуме