SBASE - коллекция последовательностей белковых доменов, предназначена для облегчения нахождения гомологий между доменами. Версия 9.0 (октябрь 2002) этой базы содержит 338655 аннотированных структурных, функциональных, лиганд-связующих и топогенных сегментов белков, которые имеют перекрестные ссылки на все общедоступные базы первичных последовательностей. Всего в базе насчитывается 5256 доменов.
Vlahovicek K., Murvai J., Barta E., Pongor S. (2002) Nucl. Acids Res., 30, 273-275.
Murvai J., Vlahovicek K., Barta E., Pongor S. (2001) Nucl. Acids Res., 29(1), 58-60.
Murvai J., Vlahovicek K., Barta E., Cataletto B., Pongor S. (2000) Nucl. Acids. Res., 28, 260-262.
Murvai J., Vlahovicek K., Barta E., Szepesvari C., Acatrinei C., Pongor S. (1999) Nucl. Acids. Res., 27, 257-259.
Fabian P., Murvai J., Hatsagi Z., Vlahovicek K., Hegyi H., Pongor S. (1997) Nucl. Acids Res., 25, 240-243.
Pongor S., Hatsagi Z., Degtyarenko K., Fabian P., Skerl V., Hegyo H., Myrvai J., Bevilacqua V. (1994) Nucl. Acids Res., 22, 3610-3615.
Адрес:
http://www3.icgeb.trieste.it/~sbasesrv/
http://www.icgeb.trieste.it/sbase/
http://sbase.abc.hu/sbase/
См. также:
RGD - Rat Genome Database
RHDB [RHdb] - Radiation Hybrid DataBase
RISSC - Ribosomal Intergenic Spacer Sequence Collection
RNase P Database - the RiboNuclease P Database
RsGDB - Rhodobacter sphaeroides Genome DataBase
SCOP - Structural Classification Of Proteins
SELEX_DB - a database on in vitro selected oligomers adapted for recognizing natural sites and for analyzing both SNPs and site-directed mutagenesis data
SeqAnalRef - Sequence Analysis bibliographic Reference database
SGD - Saccharomyces Genome Database
Биологические базы данных, snoRNA - a database for small nucleolar RNAs from Saccharomyces cerevisiae
...
Обсудить на форуме
