База данных NBRF, с 1984 года коллекционирует данные о белках. Эта база возникла на месте NBRF Protein Sequence Database, созданной M.O.Dayhoff и опубликованной впервые еще в 1965 году в виде атласа белковых последовательностей и структур (Atlas of Protein Sequence and Structure). Сейчас база PIR - продукт сотрудничества NBRF (США), MIPS (Германия) и JIPID (Japan International Protein Information Database). В России на сайте Института физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского хранится регулярно обновляемая копия (зеркало) базы (http://www.genebee.msu.su/).
George D.G., Barker W.C., Mewes H.-W., Pfeiffer F., Tsugita A. (1994) Nucl. Acids Res., 22, 3569-3573.
Barker W.C., Garavelli J.S., McGarvey P.B., Marzec C.R., Orcutt B.C., Srinivasarao G.Y., Heh L.-S.L., Ledley R.S., Mewes H.-W., Pfeiffer F., Tsugita A., Wu C. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 39-43.
Barker W. C., Garavelli J.S., Hou Z., Huang H., Ledley R.S., McGarvey P.B., Mewes H.-W., Orcutt B.C., Pfeiffer F., Tsugita A., Vinayaka C.R., Xiao C., Yeh L.-S. L., Wu C. (2001) Nucl. Acids Res., 29(1), 29-32.
Адрес:
http://www-nbrf.georgetown.edu/
http://pir.georgetown.edu/
См. также:
Биологические базы данных, ooTFD - object oriented Transcription Factors Database
OWL - Composite Protein Sequence Database
PADB - Proteome Analysis DataBase
PALI - a database of Phylogeny and ALIgnment of homologous protein structures
PFAM - Protein families database of alignments and HMMs
PIR-ALN - database of Protein sequence ALligNments
PLACE - PLAnt Cis-acting regulatory DNA Elements database
PlantCARE - Plant cis-acting regulatory DNA elements database
PlasmoDB - an integrative database of the Plasmodium falciparum genome
PLMItRNA - a database for higher Plant MItochondrial tRNAs and tRNA genes
...
Обсудить на форуме
