Эта база систематически коллекционирует семейства гомологичных доменов с помощью автоматизированного анализа всех доступных белковых последовательностей. Она снабжена интерактивным интерфейсом для удобства ориентирования в схематических классификациях доменов, множественными выравниваниями. Версия 2001.3, датированная январем 2002 года содержит 390 семейств.
Corpet F., Servant F., Gouzy J., Kahn D. (2000) Nucl. Acids. Res., 28, 267-269.
Corpet F., Gouzy J., Kahn D. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 263-267.
Corpet F., Gouzy J., Kahn D. (1998) Nucl. Acids. Res., 26, 323-326.
Sonnhammer E.L.L., Kahn D. (1994) Prot.Sci., 3, 482-492.
Адрес: http://protein.toulouse.inra.fr/prodom.html
См. также:
PMD - Protein Mutant Database
Predictome - a database of putative functional links between proteins
PRESAGE - Protein Resource Entailing Structural Annotation of Genomic Entities
PRF - Protein Research Foundation databases
PRINTS - database of protein family fingerPRINTS
ProtRepeatsDB
RDP, RDP-II - Ribosomal Database Project
Rebase - Restriction Enzyme dataBASE
RefSeq (LocusLink) - Reference Sequence standards database
RGD - Rat Genome Database
...
Обсудить на форуме
