MIDB - an eukaryotic Mismatched Intron DataBase

Без рекламы

Сайт переехал

Gerontology Explorer

База знаний по геронтологии

Форум

Рейтинг способов продления жизни

Новые материалы

Email-рассылка: информация о новых материалах на сайте

RSS-канал: информация о новых материалах на сайте

Поиск

Указатель

Экспорт, импорт

"Список"

Геронтология, общее

"Проблема"

Старение организма

"Решение"

Способы продления жизни

"Список"

Вспомогательные науки

"Список"

Библиотека

О проекте

Актуальность проблемы

Ответы на типичные возражения против радикального
продления жизни

Принципиальная возможность бессмертия

Проблемы реализации идей научного иммортализма

Инвестирование в научные исследования

Экспериментирование на животных

Проекты, ссылки

Блог Михаила Батина

Общественные организации, фонды, проекты

Проекты системной биологии старения

Биологические базы данных

Базы данных по регуляторным путям

Базы данных по метаболическим путям

Базы данных по ферментам, низкомолекулярным
веществам и реакциям

Базы данных по белок-белковым взаимодействиям

Базы данных по транскрипционным факторам

Базы данных по паттернам экспрессии генов

неклассифицированное

5S rRNA - 5S ribosomal RNAs database

AARSDB - AminoAcyl-tRNASynthetases DataBase

AGRICOLA - AGRICultural On-Line Access

AMmtDB - database of multi-aligned metazoa
mitochondrial DNA sequences

Article@inist - inist

ASDB - database of alternatively spliced genes

ASTRAL - The ASTRAL Compendium for Sequence
and Structure Analysis

AtDB(TAIR) - Arabidopsis thaliana DataBase

BIOCAT - Bio-Catalog

Biochemical Pathways

BioImage - Biological Images for scientific research

BioKnowledge Library

BioMagResBank [BMRB] - repository for data from
NMR on proteins, peptides, and nucleic acids

Blocks - most highly conserved regions of proteins

BSD - Biodegradative Strain Database

CE - Databases and Tools for 3-D Protein Structure
Comparison and Alignment

CluSTr - a database of clusters of
SWISS-PROT+TrEMBL proteins

COG - the database of Clusters of Ortologous Groups
of proteins

COMPEL - a database on COMPosite ELements

CSD - the Cambridge Structural Database

CUTG - Codon usage tabulated from GenBank

CyanoBase - the genome dataBase for Cyanobacteria

DaliDD - Dali Domain Dictionary

DBCat - a catalog of biological DataBases

DBSNP (dbSNP) - the NCBI database of genetic
variation

DBSTS [dbSTS] - DataBase of Sequence-Tagged Sites

DDBJ - DNA Data Bank of Japan

DHMHD - the Dysmorphic Human-Mouse Homology
Database

DOMO - protein domain database

DSSP - Dictionary of Secondary Structure of Proteins

EID - the Exon-Intron Database

EMBL - the EMBL Nucleotide Sequence Database

EMGLib - Enhanced Microbial Genomes Library

Ensemble - The Ensembl Genome Browser and
Annotation System

ENTREZ - Molecular Biology DataBase and Retrieval
System

EPD - Eukaryotic Promoter Database

ExInt - Exon Intron Database

ExpressDB (EXD)

FIMM - a database of functional molecular immunology

FlyBase - A Database of the Drosophila Genome

FSSP - Fold classification based on Structure-Structure
alignment of Proteins

FULL-Malaria - a database for a full-length enriched
cDNA library from human malaria parasite, Plasmodium
falciparum

GDB - Genome DataBase

GeneCards - encyclopedia for genes, proteins and
diseases

Genome MOT - Genome MOnitoring Table

GEO - Gene Expression Omnibus

GID - the Global Image Database

GKB - Genome KnowledgeBase

GO - Gene Ontology consortium database

GOBASE - The Organelle Genome Database

GOLD - Genomes On Line Database

GTOP - Genomes TO Protein structures and functions

HGMD - Human Gene Mutation Database

HGNC - The HUGO Gene Nomenclature Committee
Database

HGNDB - Human Gene Nomenclature DataBase

Histones - Histone sequence database

HIV Molecular Immunology Database

HOVERGEN - HOmologous VERtebrate GENs
database

HSSP - Homology-derived Secondary Structure of
Proteins

HUGE - Human Unidentified Gene-Encoded large
protein database

HuGeMap - the Human Genome Maps database

HUMBIO - NUMan BIOology database

HvrBase - primates mtDNA control region sequences
compilation

IEDB - Immune Epitope DataBase

IMGT - ImMunoGeneTics database

Immigrant - The database of immigrant genes

InParanoid - Eukaryotic Ortholog Groups Database

InterPro - an integrated documentation resource for
protein families, domains and functional sites

iProClass - an integrated, comprehensive and annotated
Protein Classification database

IXDB - The Integrated X Chromosome DataBase

Kabat - Kabat database of sequences of proteins of
immunological interest

LGIC - Ligand Gated Ion Channel subunit database

LSU rRNA - Large SubUnit rRNA database

MATDB - MIPS Arabidopsis Thaliana DataBase

MBDC - Molecular Biology Database Collection

MedLine - [Medline]

MEROPS - Peptidase database

MetaFam - a comprehensive protein family resource

MGI - Mouse Genome Informatics

MIDB - an eukaryotic Mismatched Intron DataBase

MitBASE - integrated Mitochondrial DNA dataBASE

MitBASE Pilot - a database on nuclear genes involved
in mitochondrial biogenesis and its regulation in
Saccharomyces cerevisiae

MitoDat - Mendelian Inheritance and the
Mitochondrion

MITOMAP - human mitochondrial genome database

MITOP - database for MITOchondria-related Proteins,
genes and diseases

MPW - Metabolic PathWays database

MSD - Macromolecular Structure Database

MTB - Mouse Tumor Biology database

MYGD - MIPS Yeast Genome Database

NDB - Nucleic acid DataBank

OMIA - On-line Mendelian Inheritance in Animals

OMIM - On-line Mendelian Inheritance in Man

ooTFD - object oriented Transcription Factors Database

OWL - Composite Protein Sequence Database

PADB - Proteome Analysis DataBase

PALI - a database of Phylogeny and ALIgnment of
homologous protein structures

PFAM - Protein families database of alignments and
HMMs

PIR - Protein Information Resource

PIR-ALN - database of Protein sequence ALligNments

PLACE - PLAnt Cis-acting regulatory DNA Elements
database

PlantCARE - Plant cis-acting regulatory DNA elements
database

PlasmoDB - an integrative database of the Plasmodium
falciparum genome

PLMItRNA - a database for higher Plant MItochondrial
tRNAs and tRNA genes

PMD - Protein Mutant Database

Predictome - a database of putative functional links
between proteins

PRESAGE - Protein Resource Entailing Structural
Annotation of Genomic Entities

PRF - Protein Research Foundation databases

PRINTS - database of protein family fingerPRINTS

ProDom - Protein Domain families database

RDP, RDP-II - Ribosomal Database Project

Rebase - Restriction Enzyme dataBASE

RefSeq (LocusLink) - Reference Sequence standards
database

RGD - Rat Genome Database

RHDB [RHdb] - Radiation Hybrid DataBase

RISSC - Ribosomal Intergenic Spacer Sequence
Collection

RNase P Database - the RiboNuclease P Database

RsGDB - Rhodobacter sphaeroides Genome DataBase

SBASE - protein domain library

SCOP - Structural Classification Of Proteins

SELEX_DB - a database on in vitro selected oligomers
adapted for recognizing natural sites and for analyzing
both SNPs and site-directed mutagenesis data

SeqAnalRef - Sequence Analysis bibliographic
Reference database

SGD - Saccharomyces Genome Database

snoRNA - a database for small nucleolar RNAs from
Saccharomyces cerevisiae

SRPDB - the Signal Recognition Particle DataBase

SSU rRNA - Small SubUnit rRNA database

SWISS-PROT - the protein sequence data bank

TDB - TIGR DataBases

The gRNA database - the guide RNA database

The Homeodomain Resource

The Molecule Pages database

TIGRFAMs - a protein family resource for the
functional identification of proteins

tmRDB - tmRNA DataBase

tmRNA - The tmRNA website

TransTerm - Translational Termination signal database

TRDB - Tandem Repeats DataBase

trEMBL - EMBL protein-coding DNA sequence
features translated into peptide sequences

tRNA - database of tRNA sequences

TTD - Therapeutic Target Database

UDB - the Unified DataBase for Human Genome
Mapping

UniProt - the Universal Protein knowledgebase

Vertebrate MitBASE - a dataBASE on Vertebrate
Mitochondrial DNA sequences

Virgil - Virgil database for rich links

WANDA - A database of duplicated genes in fish

YPD - Yeast Proteome Database

Z Curve Database - Z Curve Database of Genomes

ZFIN - The Zebrafish Information Network

Сайты с общей информацией по старению и
антистарению

Геронтологические центры

Лечебные учреждения

НИИ и лаборатории

Геронтологи

RSS-ленты блогов, сообществ, сайтов, форумов,
посвященных тематике радикального продления жизни

Персоналии

MIDB - an eukaryotic Mismatched Intron DataBase

Геронтология, общее < Проекты, ссылки < Биологические базы данных ...

Перемещение (скольжение) границ интронов очень важно в объяснении распределения интронов между ортологичными и паралогичными генами. База данных несовпадающих интронов MIDB дает возможность изучать подвижные границы интронов по положениям интронов в гомологичных белках.

Sakharkar M.K., Tan T.W., de Souza S.J. (2001) Bioinformatics, 17(8), 671-675.

Адрес: http://sege.ntu.edu.sg/wester/midb/

Источник...

Источник:

Сайт: Молекулярная биология.

Статья: Молекулярно-биологические базы данных.

Статья: MIDB - an eukaryotic Mismatched Intron DataBase.

См. также:

"Решение" MBDC - Molecular Biology Database Collection

"Решение" MedLine - [Medline]

"Решение" MEROPS - Peptidase database

"Решение" MetaFam - a comprehensive protein family resource

"Решение" MGI - Mouse Genome Informatics

"Решение" MitBASE - integrated Mitochondrial DNA dataBASE

"Решение" MitBASE Pilot - a database on nuclear genes involved in mitochondrial biogenesis and its regulation in Saccharomyces cerevisiae

"Решение" MitoDat - Mendelian Inheritance and the Mitochondrion

"Решение" MITOMAP - human mitochondrial genome database

"Решение" MITONUC

...

Обсудить на форуме

Изменен: 27.12.10

	Узлов всего: 3 914. Узлов на вкладке: 502. Узлов в узле: 0. Последнее обновление: 20.01.13 19:01
	Gerontology Explorer ©, 2007 - 2013. Все права защищены. Для правообладателей Обратная связь

Хостинг от uCoz