Последовательности tmRNA (10Sa РНК) играют центральную роль в trans-трансляции, при которой свободный конец белка, кодируемый tmRNA добавляется к короткому белковому продукту прерванной мРНК как сигнал для протеолизиса всего меченного таким образом белка.
База содержит последовательности таких РНК, которые упорядочены по алфавиту и филогенетически. База содержит некоторое количество выравниваний, вторичных структур, трехмерных моделей, построенных программой ERNA-3D. Есть еще tmRNA-website http://www.indiana.edu/~tmrna/.
Zwieb, C., Gorodkin, J., Knudsen B., Burks, J., and Wower, J. (2003) tmRDB (tmRNA database) Nucleic Acids Res, 31, 446-447
Knudsen B., Wower J., Zwieb Ch., Gorodkin J. (2001) Nucl. Acids Res., 29, 171-172.
Zwieb Ch., Wower J. (2000) Nucl. Acids Res., 28, 169-170.
Wower J., Zweib Ch. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 167.
Адрес: http://rnp.uthct.edu/rnp/tmRDB/tmRDB.html
См. также:
TDB - TIGR DataBases
The gRNA database - the guide RNA database
The Homeodomain Resource
The Molecule Pages database
TIGRFAMs - a protein family resource for the functional identification of proteins
Биологические базы данных, tmRNA - The tmRNA website
TransTerm - Translational Termination signal database
TRDB - Tandem Repeats DataBase
Биологические базы данных, trEMBL - EMBL protein-coding DNA sequence features translated into peptide sequences
Биологические базы данных, tRNA - database of tRNA sequences
...
Обсудить на форуме
