Gerontology Explorer
База знаний по геронтологии
Форум Рейтинг способов продления жизни Новые материалы Email-рассылка: информация о новых материалах на сайте RSS-канал: информация о новых материалах на сайте Поиск Указатель Экспорт, импорт

     
EcoCyc - Encyclopedia of E.coli Genes and Metabolism

Синонимы: EcoCyc

 

База данных по метаболизму модельного организма Escherichia coli K-12 MG1655. EcoCyc создана на основе литературных данных о всем геноме, регуляции транскрипции, транспортов и метаболических путей.

 


 

Биоинформационная база данных, описывающая геном и биохимию кишечной палочки Escherichia coli. Описывает все метаболические и сигнал-трансдукционные пути этого организма, все ферменты, их кофакторы, активаторы, ингибиторы, субъединичную структуру. Гены, кодирующие субъединицы ферментов с их локализацией на хромосоме, а также гены транспортных белков и тРНК содержатся в базе. Статистика содержимого базы такова: 4391 ген, 695 ферментов кодированных подмножеством множества всех генов, 904 метаболические реакции, протекающие в организме E.coli, и организация этих реакций в 129 метаболических путей. Кроме исследовательских целей может использоваться как учебное пособие по биохимии, т.к. содержит в себе широкие возможности по конструированию новых биохимических путей для биотехнологии. Произносится как "eeko-sike". Принадлежит Pangea Systems Corp., для академических учереждений предоставляется бесплатно.

 

Karp P.D., Riley M., Saier M., Paulsen I.T., Collado-Vides J., Paley S.M., Pellegrini-Toole A., Bonavides C., Gama-Castro S. (2002) Nucl. Acids Res., 30, 56-58.

 

Karp P.D., Riley M., Saier M., Paulsen I.T., Paley S.M., Pellegrini-Toole A. (2000) Nucl. Acids Res., 28, 56-59.

Ouzounis C.A., Karp P.D. (2000) Genome Res., 10, 568-576.

Karp P., Riley M., Paley S., Pellegrini-Toole A., Krummenacker M. (1999) Nucl. Acids Res., 27(1), 55-58.

Karp P.D., Riley M., Paley S.M., Pellegrini-Toole A., Krummenacker M. (1998) Nucl. Acids Res., 26, 50-53.

Karp P.D., Riley M., Paley S.M., Pellegrini-Toole A., Krummenacker M. (1997) Nucl. Acids Res., 25, 43-51.

Karp P.D., Riley M., Paley S.M., Pelligrini-Toole A. (1996) Nucl. Acids. Res., 24, 32-39.

 

Адрес: http://www.ecocyc.org/

 


 

EcoCyc: E. coli Genes and Metabolism (http://ecocyc.org/)


 

Долгосрочной целью проекта является описание молекулярного каталога клетки E. coli, а также функций каждой из её маолекулярных частей, чтобы облегчить понимание E. coli на системном уровне. EcoCyc является электронным справочным ресурсом для биологово E. coli и биологов, которые работают с родственными микроорганизмами.


 

См. также:  MetaCyc - Database of metabolic pathways and enzymes.

 

 Обсудить на форуме

 

Изменен: 27.12.10

Узлов всего: 3 914. Узлов на вкладке: 502. Узлов в узле: 0. Последнее обновление: 20.01.13 19:01

Gerontology Explorer ©, 2007 - 2013. Все права защищены. Для правообладателей Обратная связь

Хостинг от uCoz