MetaCyc - одна из подбаз большой коллекции BioCyc. Она представляет собой неизбыточный набор экспериментально подтвержденных метаболических путей. На начало 2009 года база содержит более 1200 путей из 1600 различных организмов, пополняется данными из экспериметальных научных статей. Содержит пути, вовлеченные в первичный и вторичный метаболизм,а также соответствующие метаболиты, ферменты и гены.
R. Caspi, H. Foerster, C.A. Fulcher, P. Kaipa, M. Krummenacker, M. Latendresse, S. Paley, S.Y. Rhee, A.G. Shearer, Ch. Tissier, Th.C. Walk, P. Zhang, P.D. Karp. Nucleic Acids Research, 2008, Vol. 36, Database issue, D623-D631.
Адрес: http://metacyc.org/
MetaCyc: Metabolism from 150 species (http://metacyc.org/)
|
|
Сайт: Институт цитологии и генетики.
Статья: "Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития", А.В. Ратушный, В.А. Лихошвай, Е.А. Ананько, Н.В. Владимиров, К.В. Гунбин, С.А. Лашин, Е.А. Недосекина, С.В. Николаев, Л.В. Омельянчук, Ю.Г. Матушкин, Н.А. Колчанов, 2005 г.
Исходный раздел: Базы данных по метаболическим путям
|
См. также: EcoCyc - Encyclopedia of E.coli Genes and Metabolism.
Обсудить на форуме