Синонимы: Схема Фурбера; Схема Фарбера
{LinkStart}Изображение полностью (4Мб)
Верхняя часть схемы описывает процессы на молекулярном уровне (в центре - все, что происходит внутри клетки, справа - во внеклеточном пространстве). Средняя часть описывает процессы на клеточном уровне, а нижняя - на уровне тканей, органов и всего организма. В целом схема показывает взаимосвязь всех процессов в организме человека.
Цвет и форма элементов схемы, а также форма и толщина стрелок имеют особое значение. Они описаны внизу, в разделах «Что обозначает цвет» и «Что обозначает форма».
Для нас наиболее интересны зеленые восьмигранники - именно они показывают, какие полезные воздействия могут быть произведены извне, чтобы улучшить состояние организма, замедлить протекающие в нем процессы старения. Особенно важны взаимосвязи, показанные зелеными стрелочками, которые венчает зеленый же кружок с крестиком внутри. Это означает, что тот процесс, на который направлена стрелка, можно изменить.
Эти зеленые кружочки - как маяки для составления плана научных исследований по поиску методов, замедляющих старение организма.
Джон Фурбер (Legendary Pharmasueticals, Флорида, США) посвятил свой доклад графическому представлению системной биологии старения. Он подчеркнул необходимость видения полной картины процесса старения. В качестве примера графического представления процессов Джон Фурбер рассматривал и сравнивал свою схему процессов старения и Графическую Систему Обозначений Системной Биологии - Systems Biology Graphical Notation. Мы писали об этой системе ранее. Доктор Фурбер обратил внимание на некоторые недостатки последней: отсутствие цветности и невозможность использования новых элементов. По его мнению необходимо использовать «мозг по-максимуму, а не спускаться до уровня черно-белой факсовой машины». Отказ разработчиков SBGN от цветности мотивировался невозможностью передачи цветных изображений по факсу!! (Нет, вы только вдумайтесь, люди отказались от цвета в инфографике, только из-за мыслей о том, как они свои схемы будут передавать по факсу) В то же время схема доктора Фурбера многоцветна, где цвет несет информацию (например, голубым отмечены процессы, происходящие в ядре клетки, а сиреневым - метаболические пути). Такая схема может служить живым учебником, на ней могут быть отражены несколько различных гипотез, также показана динамика изменений в тканях со временем (отражается в форме элементов, где слева прошлое, справа - будущее). Также Джон Фурбер поставил несколько вопросов, на которые, возможно, в какой-то момент удастся ответить с помощью его схемы:
1. Какова основная причина старения: программа развития или накопление повреждений?
2. Что более целесообразно: изменение скорости накопления повреждений или «починка» повреждений?
3. К чему может привести остановка роста?
4. Является ли старение побочным эффектом программы развития?
5. Могут ли вычислительные модели помощь биологам?
См. подраздел 
ярлык: Инженерия онтологий.
Обсудить на форуме
