Крупнейшая в мире публичная база данных по ферментам и метаболическим путям. Она представляет из себя продукт сотрудничества Аргонской национальной лаборатории и Института теоретической биофизики РАН (г.Пущино, Россия), координируемого профессором Е.Е.Сельковым. Предназначена для создания детальных реконструкций вновь секвенированных геномов. База данных EMP/MPW содержит 28100 записей, которые отражают данные более 17500 публикаций по 8000 организмам. В базе данные о 3900 ферментах, включая информацию об их специфичности, энзимологических константах, протоколах очистки, регуляции, ингибиторах и активаторах.
Selkov E., Galimova M., Goryanin I., Gretchkin Y., Ivanova N., Komarov Y., Maltsev N., Mikhailova N., Nenashev V., Overbeek R., Panyushkina E., Pronevitch L., Selkov E.,Jr. (1997) Nucl. Acids Res., 25, 37-38.
Selkov E., Basmanova S., Gaasterland T., Goryanin I., Gretchkin Y., Maltsev N., Nenashev V., Overbeek R., Panyushkina E., Pronevitch L., Selkov E.,Jr, Yunus I. (1996), Nucleic Acids Res., 24, 26-28.
Адрес: http://igweb.integratedgenomics.com/EMP/
EMP: Enzymes and Metabolic Pathways (http://emp.mcs.anl.gov/)
|
|
|
Сайт: Институт цитологии и генетики.
Статья: "Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития", А.В. Ратушный, В.А. Лихошвай, Е.А. Ананько, Н.В. Владимиров, К.В. Гунбин, С.А. Лашин, Е.А. Недосекина, С.В. Николаев, Л.В. Омельянчук, Ю.Г. Матушкин, Н.А. Колчанов, 2005 г.
Исходный раздел: Базы данных по метаболическим путям
|
См. также:
WIT
UM-BBD - University of Minnesota Biocatalysis/Biodegradation Database
BioCyc
HumanCyc
SoyBase - Soybean metabolism dataBase
Metalgen
Boehringer Mannheim
IUBMB-Nicholson Minimaps
Обсудить на форуме
