Описаны биокаталитические реакции у микробов и биодеградационные пути, в первую очередь, для ксенобиотических (xenobiotic) и химических соединений. База данных содержит отдельные реакции и метаболические пути с информацией об исходных и промежуточных химических компонентах, об организмах, которые влияют на эти компоненты, ферментах и генах. Последняя версия базы содержит информацию о 96 метаболических путях, 662 реакциях, 595 соединении, 424 ферменте. Поддерживается Center for Biodegradation Research and Informatics (Minnesota University, US)
Ellis LBM, Roe D, Wackett LP (2006) Nucleic Acids Research 34: D517-D521.
Ellis L.B.M., Hershberger C.D., Bryan E.M., Wackett L.P. (2001) Nucl. Acids Res., 29, 340-343.
Ellis L.B.M., Hershberger C.D., Wackett L.P. (2000) Nucl. Acids Res., 28, 377-379.
Ellis L.B.M., Hershberger C.D., Wackett L.P. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 373-376.
Адрес: http://umbbd.msi.umn.edu/
UM-BBD: Microbial Biocatalysis/Biodegradatation (http://umbbd.ahc.umn.edu/)
|
|
|
Сайт: Институт цитологии и генетики.
Статья: "Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития", А.В. Ратушный, В.А. Лихошвай, Е.А. Ананько, Н.В. Владимиров, К.В. Гунбин, С.А. Лашин, Е.А. Недосекина, С.В. Николаев, Л.В. Омельянчук, Ю.Г. Матушкин, Н.А. Колчанов, 2005 г.
Исходный раздел: Базы данных по метаболическим путям
|
См. также:
EMP - the Enzymes and Metabolic Pathways database
WIT
BioCyc
HumanCyc
SoyBase - Soybean metabolism dataBase
Metalgen
Boehringer Mannheim
IUBMB-Nicholson Minimaps
Обсудить на форуме
