Научная работа Андреаса Крита (Университет Дрекселя, Пенсильвания, США) нацелена на создание интегрированного экспериментального и вычислительного подхода к разработке компьютерной модели старения клетки. Профессор Крит описал замкнутый рабочий процесс системной биологии: экспериментальные данные инициируют создание концептуальных и графических основ, которые после математической формализации превращаются в вычичлительные инструменты, которые в свою очередь после симуляции или моделирования дают новые экспериментальные данные. Поскольку данные, с помощью которых описываются биологические объекты мультимодальные, необходима интегрированная модель (рассматривается клеточный уровень). В основе предлагаемой концептуальной основы лежит рассмотрение элементов (мотивов) петель обратных связей. Способ обработки данных - использование нечеткой логики. С помощью таких моделей можно описывать, например, замкнутый круг митохондрия-активные формы кислорода или воспаление.
См. также:
Системная схема старения человека (Human Aging System Diagram - HASD)
Журнал "Старение и гены"
Associative Network Discovery (AND) - компьютерная система для автоматической реконструкции сетей ассоциативных знаний о молекулярно-генетических взаимодействиях
Проект Crocodile2010
Среда BioUML - Biological Unified Modeling Language
Генные сети
Применение булева моделирования для описания биологических моделей
Моделирование на основании формальных утверждений
Объединение баз данных и информации, полученых в большом количестве областей
Проекты системной биологии старения, прочие
...
Обсудить на форуме
