База данных различных паттернов функциональных и регуляторных участков. С помощью этой коллекции можно определить, принадлежит ли, и к какому именно, семейству белков новая последовательность пользователя, или какой важный домен она содержит. Версия 17.21 этой базы, датированная сентябрем 2002 года содержит 11148 единиц хранения, которые описывают 1568 различных паттернов, правил и матриц.
Falquet L., Pagni M., Bucher P., Hulo N., Sigrist C.J.A., Hofmann K., Bairoch A. (2002) Nucl. Acids. Res., 30, 235-238.
Hofmann K., Bucher P., Falquet L., Bairoch A. (1999) Nucl. Acids Res., 27, 215-219.
Bairoch A., Bucher P. (1994) Nucl. Acids Res., 22, 3583-3589.
Адрес: http://www.expasy.ch/prosite/
PROMISE: Prosthetic Groups and Metal Ions (http://metallo.scripps.edu/PROMISE/)
|
|
|
Сайт: Институт цитологии и генетики.
Статья: "Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития", А.В. Ратушный, В.А. Лихошвай, Е.А. Ананько, Н.В. Владимиров, К.В. Гунбин, С.А. Лашин, Е.А. Недосекина, С.В. Николаев, Л.В. Омельянчук, Ю.Г. Матушкин, Н.А. Колчанов, 2005 г.
Исходный раздел: Базы данных по ферментам, низкомолекулярным веществам и реакциям
|
См. также:
BRENDA - enzyme database
Worthington Enzyme Manual
Klotho - biochemical compounds declarative database
ChemFinder
ChemIDplus at NLM
GlycoSuiteDB
CarbBank
LIPIDBANK
WebElements
PDB - Brookhaven Protein DataBank
...
Обсудить на форуме
